Consideraciones: 

Al efectuar retenciones a proveedores, el sistema toma de forma automática la base de cálculo de los documentos que se seleccionen para pagar. En caso de ser necesario, ajustar la base de cálculo de las retenciones; esto se puede hacer desde la orden de pago.

Proceso:

1- Seleccionar los documentos a incluir en la OP.

2- En la solapa Impuestos, se visualizan las retenciones asignadas en el maestro de proveedores, pero puede modificarse el tipo de retención de ganancias o los % en el caso de IVA e IIBB.

3- En la solapa "Registros Manuales", se puede visualizar el cálculo de las retenciones.

4- Para modificar las retenciones, se debe hacer click con el botón secundario sobre el renglón de la factura a modificar:

Luego, se puede elegir qué retenciones ajustar (solo aparecerán disponibles las que tengan importe calculado).

Al marcar modificar, se abre una ventana en la que, dependiendo el tipo de impuesto, se podrá cambiar el monto de la retención o su base:

Una vez confirmados los cambios, al grabar la orden, quedarán establecidas las retenciones.

Opciones que pueden ser de interés:

¿Cómo establezco la base imponible para ganancias? (Argentina)